Caractérisation et quantification des protéines

Responsable : Jean-Christophe Helbling : jean-christophe.helbling@inrae.fr

Objectifs : Fournir des outils performants pour l’extraction, la caractérisation et la quantification des protéines afin d’étudier leurs rôles dans divers contextes biologiques et élucider les mécanismes moléculaires impliqués dans des processus physiopathologiques complexes.

Présentation : Le laboratoire propose une gamme complète de techniques pour l’analyse des protéines, adaptées à divers types d’échantillons biologiques. Ces approches permettent une caractérisation précise et reproductible des protéines, allant de leur extraction à leur détection spécifique.

Nos compétences : Nous maîtrisons des méthodes avancées pour répondre aux besoins en analyse protéique :

- Extraction et quantification des protéines : à partir de tissus (notamment structures cérébrales), de cellules isolées, de compartiments subcellulaires ou de microdomaines spécifiques comme les rafts.

- Western blot : pour l’identification et la quantification spécifiques des protéines d’intérêt.

- Immunoprécipitation : pour isoler et étudier des complexes protéiques spécifiques.

- Analyse en fluorescence des protéines avec le système Odyssey : une technologie basée sur la détection en fluorescence pour une quantification précise et sensible, réalisée en collaboration avec la plateforme de biochimie de Magendie (INSERM).

Appareillage disponible : Notre laboratoire s’appuie sur des équipements performants, complétés par des collaborations avec des plateformes spécialisées :

- TissueLyser II Qiagen : pour la préparation mécanique des échantillons avant extraction protéique.

- NanoDrop One : pour la quantification rapide des protéines.

- GelDoc Bio-Rad : pour l’imagerie et l’analyse des gels et membranes Western.

- Odyssey LI-COR : pour une détection en fluorescence à haute sensibilité, permettant des analyses multiparamétriques de protéines marquées.

Points forts :

- Flexibilité des échantillons : structures cérébrales, cellules isolées, fractions subcellulaires et rafts.

- Technologies avancées : y compris la détection en fluorescence avec le LI-COR Odyssey, en partenariat avec la plateforme de biochimie de Magendie (INSERM).

- Expertise scientifique : accompagnement dans la conception des expériences et l’interprétation des données protéiques.

Applications possibles :

- Étude des profils d’expression protéique dans des conditions normales et pathologiques.

- Analyse des interactions protéine-protéine.

- Identification et caractérisation de biomarqueurs spécifiques.